La PCR de metilación es un mecanismo de regulación de la expresión de genes, consiste en una adición de grupos metilo a las citosinas de ciertas secuencias del DNA lo cual da una modificación química que puede producir silenciamiento de un gen. En el genoma de HBV puede persistir en el nucleo de los hepatocitos en forma de mini cromosoma por lo cual es posible que la metilación de DNA de HBV represente un mecanismo que puede modifica la replicación y la expresión de proteínas virales.
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